Яя – посёлок городского типа на Транссибирской магистрали и административный центр одноимённого района.
Самым старым населенным пунктом на территории современного поселка Яя являлась деревня Жарковка. Появилась она, вероятнее всего, на месте стойбища коренных жителей этих мест – чулымских тюрков. Появилось оно, вероятнее всего, на месте стойбища коренных жителей этих мест, чулымских тюрков, у реки, которая носила название – «Яй». «Яй» по-тюркски означает «лето», «летнее пастбище», «летовка». Русские, пришедшие сюда в начале 18 века, немного изменив название, речку стали называть «Яя», а в конце ХIХ века при строительстве Транссиба так стали называть и пристанционный поселок.
Деревня была так названа по одной из версий – по фамилии первых жителей; по другой – в честь цветов «жарков». Занималось население деревни земледелием, охотой, ямщицким извозом на Московско-Иркутском тракте. В 1859 году Жарковка насчитывала 358 жителей. К концу ХIХ века население пополнилось крестьянами - переселенцами из Пермской, Воронежской, Тамбовской, Орловской, Курской губерний. Десятую часть населения составляли ссыльные. После возведения в Жарковке храма, названного в честь святого Онуфрия в 1859 году, деревня получила статус села.
Со строительством железнодорожной станции и железнодорожного моста в 1893-1896 годах в пристанционный поселок Яя, расположенный в километре от села переселилась часть жителей Жарковки.
В 1917 году Томский лесопромышленник Пётр Макарович Тимофеев построил в Яе маленький лесопильный заводик, который после реконструкции проведенной к середине 30-х годов превратился в большой лесопильный завод с лесозаготовительными пунктами в тайге.
По переписи 1926 года в селе Жарковском Судженского района Томского округа Западно-Сибирского края числилось 336 хозяйств и 1569 жителей. В селе было две школы, изба-читальня, две лавки.
В годы первых пятилеток в посёлке было создано добровольное спортивное общество «Осовиахим». По инициативе комсомольцев были приобретены два планера, построен ангар, а в центре поселка, по улице Советской, появилась парашютная вышка.
В 1934 решением руководства Анжеро-Судженского горсовета село Жарковское, пристанционный поселок Яя и поселок рабочих лесопильного завода были объединены в один населенный пункт - рабочий поселок Яя.
В 1936 году в поселке насчитывалось почти 9 тысяч жителей, было 11 магазинов, 2 столовые, 4 школы, детские ясли, детский сад.
В 1946 году в поселке Яя была открыта Центральная районная библиотека. Вначале библиотека размещалась в клубе лесопромышленного комбината (ЛПК ) по улице Ленина, потом в здании почты. Через год, в1947 году для библиотеки было построено новое помещение по улице Красноармейская №3.
В том же 1947 году в Яе был построен аэродром, организован авиаотряд численностью 35 человек. В 50-60-е годы 20 века аэродром принадлежал лагерному управлению Севкузбасслага, обеспечивая связь с лесозаготовительными точками: Алчедатом, Ампалыком, Ольгинской, Муртюком и др. В 60-70-е годы были организованы регулярные пассажирские авиарейсы самолетами Ан-24 в город Кемерово и другие населенные пункты.
В середине 20 века начинается интенсивное развитие рабочего поселка Яя. В 50- 60-е годы были построены: новое здание школ №1, №2, детский сад « Ромашка », Дом пионеров, пивзавод, кинотеатр "Планета". По улице Ленина был заложен сквер. Выстроились корпуса жилых зданий по улицам Нахимова и Чехова , в центре поселка заасфальтировали тротуары, был построен Районный дом культуры, открылись ресторан "Волна", магазины: "Фиалка" и "Березка", профсоюзная библиотека ЛПК и библиотека технической литературы для сотрудников ЛПК, гостиница.
В1967 году по улице Советской состоялось торжественное открытие памятника воинам-землякам, погибшим в годы Великой Отечественной войны .
В 70-е годы были асфальтированы центральные улицы поселка, построено трёхэтажное здание районного узла связи, Вдоль анжерского озера появилась новая улица Анжерская состоящая из двухэтажных и трехэтажных домов закончено строительство центрального корпуса районной больницы.
В начале 80-х пущены в эксплуатацию: Универмаг, двухэтажная школа №3,контора ПОЖКХ. Первая пятиэтажка, по улице Ленина приняла своих жителей в 1982 году. А концу 80-х по центральной улице поселка уже взметнулись ввысь 5 пятиэтажных домов.
Центральная районная библиотека и детская библиотека в 1989 году переехала в новое помещение (заняла 2 этажа жилого дома по ул.Заводская, 3). Сдан в эксплуатацию пионерский лагерь "Белая роща".
На базе ПСХК "Яйский" в 2003 году образовалась ООО Агрофирма "Кайгат".
В 2002 году открыт парк «Тополёк»и введен в эксплуатацию дом №8 улице Ленина
В 2004 году торжественно открыта Детская школа искусств.
В 2005 году состоялось торжественное открытие "Обелиска Славы", посвященного 60-летию Победы в Великой Отечественной войне.
С 1.1.2006 года в связи с вступлением в силу Федерального закона №131 «Об организации местного самоуправления Российской Федерации» было образовано городское поселение с административным центром п.г.т. Яя.